Подскажите кто нибудь что я делаю неправильно?
import java.util.*;
import static java.lang.Math.*;

public class Sqrt{
    public static void main(String[] args){
        Scanner in = new Scanner(System.in);
        System.out.println(sqrt(in.nextInt()));
    }
}

Почитайте про циклы.
http://kostin.ws/java/java-loops.html